| Наименование РИД |
Программа для ЭВМ:
«Web-приложение для генотипирования вируса лейкоза крупного рогатого скота (BLV) на основе анализа олигонуклеотидных последовательностей в локусе env-гена»
|
| Реферат |
Программа позволяет быстро и точно определять генотип BLV путем поиска идентификационно-значимых олигонуклеотидов. Программа реализует полный алгоритм генотипирования BLV для всех 13 известных генотипов согласно современной классификации. Система анализирует введенную последовательность env-гена и сопоставляет её с базой данных специфических олигонуклеотидных маркеров для каждого генотипа. Особое внимание уделено обработке смешанных нуклеотидов согласно номенклатуре IUPAC. Программа корректно интерпретирует коды типа R (A/G), Y (C/T), M (A/C), K (G/T), S (C/G), W (A/T) и другие вырожденные позиции, что критически важно для точной идентификации генотипов в анализируемых образцах. Система использует дифференциальную логику поиска для различных генотипов: логика "И" - для генотипов 1, 2, 6, 7 требуется обнаружение всех указанных олигонуклеотидов одновременно; логика "ИЛИ" - для генотипов 5, 11, 12, 13 достаточно найти любую из указанных последовательностей; единичные маркеры - генотипы 3, 4, 8, 9, 10 идентифицируются по одному специфическому олигонуклеотиду. Использование множественных олигонуклеотидных маркеров повышает специфичность генотипирования по сравнению с анализом единичных SNP. Программа не требует установки специального программного обеспечения и доступна через любой современный браузер. Система представляет собой биоинформационный инструмент для рутинного генотипирования изолятов BLV в молекулярно-генетических лабораториях. Тип ЭВМ: IBM PC-совмест. ПК; ОС: Windows 7/8/10/11, MacOS 10.12 и выше.
|
| Возможные направления использования |
Программа позволяет быстро и точно определять генотип BLV путем поиска идентификационно-значимых олигонуклеотидов. Программа реализует полный алгоритм генотипирования BLV для всех 13 известных генотипов согласно современной классификации. Система анализирует введенную последовательность env-гена и сопоставляет её с базой данных специфических олигонуклеотидных маркеров для каждого генотипа.
|
| Количество опытных образцов |
1
|
| Количество просмотров |
1
|
| Наличие дополнительных файлов |
False
|
| Использование РИД правообладателем |
False
|
| Внешнее использование РИД |
False
|
| НИОКТР (JSON) |
{}
|
| ИКСИ (JSON) |
[]
|
| ИКСПО (JSON) |
[]
|
| ОЭСР (JSON) |
[]
|
| Дата первого статуса |
2026-02-03T11:51:16.919784+00:00
|
| Предполагаемый тип результата |
Программа для ЭВМ
|
| Ожидаемая роль |
Исполнитель
|
| Заказчик |
Российский научный фонд
|
| Руководитель работы |
Гильманов Хамид Халимович
|
| Руководитель организации |
Гулюкин Алексей Михайлович
|
| Регистрационный номер НИОКТР |
—
|
| Последний статус |
Подтверждена, 626020500287-8, 2026-02-05 13:47:38 UTC
|
| ОКПД |
Услуги ветеринарные для сельскохозяйственных животных
|
| Ключевые слова |
специфические олигонуклеотидные маркеры; анализ олигонуклеотидных последовательностей в локусе env-гена; генотипирование вируса лейкоза крупного рогатого скота (BLV); Web-приложение; Программа для ЭВМ
|
| Исполнители |
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ НАУЧНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ "ФЕДЕРАЛЬНЫЙ НАУЧНЫЙ ЦЕНТР - ВСЕРОССИЙСКИЙ НАУЧНО-ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ИНСТИТУТ ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНОЙ ВЕТЕРИНАРИИ ИМЕНИ К.И. СКРЯБИНА И Я.Р. КОВАЛЕНКО РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК"
|
| Авторы |
Шастин Павел Николаевич; Лопунов Сергей Витальевич; Савинов Василий Александрович; Капустин Андрей Владимирович; Гильманов Хамид Халимович
|
| Коды тематических рубрик |
68.41.01 - Общие вопросы
|
| OESR |
Ветеринарные науки
|
| Приоритеты научно-технического развития |
г) переход к высокопродуктивному и экологически чистому агро- и аквахозяйству, разработку и внедрение систем рационального применения средств химической и биологической защиты сельскохозяйственных растений и животных, хранение и эффективную переработку сельскохозяйственной продукции, создание безопасных и качественных, в том числе функциональных, продуктов питания;
|
