| Наименование РИД |
Генетическая база однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) сортов и гибридов персика Prunus persica
|
| Реферат |
Назначение: накопление, хранение и актуализация информации об однонуклеотидных полиморфизмах (SNP) сортов и гибридов персика Prunus persica (L.) Batsch из коллекции Никитского ботанического сада и других регионов и коллекций. База данных дает возможность проводить анализ популяционной структуры и генетической изменчивости персика, а также является основой для проведения полногеномного анализа ассоциаций локусов генома с хозяйственно-ценными признаками (GWAS анализ). SNP, для которых показана ассоциация с целевым хозяйственным признаком могут использоваться в дальнейшем селекционном процесс с целью создания новых сортов методами геномной селекции. База данных позволяет проводить сравнительный анализ с другими базами SNP данных, так как каждый SNP имеет точную локализацию на хромосоме на основе полного референсного генома персика (номер в NCBI GCA_000346465.2). База данных имеет простую и стандартную структуру для данных SNP для диплоидного организма (тип представления данных HapMap) в формате файла tsv (tab-separated values). База хранится на вычислительном сервере КГЦ НБС-ННЦ.
Вид и версия системы управления базой данных: Microsoft Excel
Объем базы данных: 164Мб
|
| Возможные направления использования |
Позволяет определить гомозиготные и гетерозиготные локусы, а также делеции. В ней указаны такие параметры как: название сортов, положение SNP, аллель.
|
| Количество опытных образцов |
1
|
| Количество просмотров |
3
|
| Наличие дополнительных файлов |
True
|
| Использование РИД правообладателем |
False
|
| Внешнее использование РИД |
False
|
| НИОКТР (JSON) |
{}
|
| ИКСИ (JSON) |
[]
|
| ИКСПО (JSON) |
[]
|
| ОЭСР (JSON) |
[]
|
| Дата первого статуса |
2025-12-09T08:03:44.821479+00:00
|
| Предполагаемый тип результата |
База данных
|
| Ожидаемая роль |
Исполнитель
|
| Заказчик |
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
|
| Руководитель работы |
Водясова Екатерина Александровна
|
| Руководитель организации |
Плугатарь Юрий Владимирович
|
| Регистрационный номер НИОКТР |
АААА-А20-120012990018-5
|
| Последний статус |
Подтверждена, 625122300637-5, 2025-12-23 20:29:11 UTC
|
| ОКПД |
Нет
|
| Ключевые слова |
база данных (БД); персик (Prunus persica); генетическая изменчивость; полногеномный анализ ассоциаций (GWAS); однонуклеотидные полиморфизмы (SNP)
|
| Исполнители |
Федеральное государственное бюджетное учреждение науки "Ордена Трудового Красного Знамени Никитский ботанический сад - Национальный научный центр РАН"
|
| Авторы |
Цюпка Валентина Анатольевна; Смыков Анатолий Владимирович; Водясова Екатерина Александровна
|
| Коды тематических рубрик |
34.23.57 - Генетика и селекция растений
|
| OESR |
Селекция с помощью маркеров
|
| Приоритеты научно-технического развития |
г) переход к высокопродуктивному и экологически чистому агро- и аквахозяйству, разработку и внедрение систем рационального применения средств химической и биологической защиты сельскохозяйственных растений и животных, хранение и эффективную переработку сельскохозяйственной продукции, создание безопасных и качественных, в том числе функциональных, продуктов питания;
|
