| Наименование РИД |
«Компьютерно-реализуемый способ анализа данных высокопроизводительного секвенирования с целью комплексной характеристики опухолевых клеток млекопитающего»
|
| Реферат |
Настоящее изобретение относится к области биоинформатики, медицинской геномики,
онкологии и персонализированной медицины. Техническим результатом изобретения является
расширение арсенала компьютерно-реализуемых способов анализа данных
высокопроизводительного секвенирования с целью комплексной характеристики опухолевой
ткани млекопитающего, в том числе для определения соматических мутаций и крупных
структурных изменений в опухолевых клетках по сравнению с нормальными клетками
млекопитающего. Технический результат достигается тем, что разработан компьютернореализуемый способ анализа данных высокопроизводительного секвенирования для
комплексной характеристики опухолевых клеток млекопитающих. При этом существует
вариант разработанного компьютерно-реализуемого способа, который дополнительно содержит
стадию формирования отчета. Также технический результат достигается тем, что создана
система анализа данных высокопроизводительного секвенирования для комплексной
характеристики опухолевых клеток млекопитающих, содержащая процессор и память, в которой
хранятся машиночитаемые инструкции для реализации операций разработанного способа,
модуль ввода данных; программный интерфейс, обеспечивающий интеграцию с
биоинформатическими пайплайнами. Кроме того, технический результат достигается тем, что
создан биоинформатический конвейер для определения опухолевых неоантигенов, содержащий
созданную систему, включающий также процессор, при работе которого обеспечивается
передача результатов. При этом результатом работы биоинформатического конвейера является
определение списка опухолевых неоантигенов, которые могут быть использованы для
разработки противоопухолевой терапевтической вакцины. А также результатом работы
биоинформатического конвейера является определение последовательности мРНК
противоопухолевой терапевтической вакцины. Технический результат также достигается тем,
что создан машинно-читаемый носитель, хранящий инструкции для выполнения операций
разработанного способа.
|
| Возможные направления использования |
Изобретение относится к области биоинформатики, медицинской геномики, онкологии и персонализированной медицины. Способ предназначен для комплексной обработки (анализа) первичных данных высокопроизводительного секвенирования, полученных из образцов, содержащих опухолевые клетки млекопитающих с целью выявления соматических мутаций (SNV и INDEL, CNV), нарушений на уровне РНК (альтернативный сплайсинг, фьюжен-варианты), а также определения уровня экспрессии генов и HLA-типирования. Полученные данные могут применяться для выбора оптимальных методов терапии, в том числе разработке мРНК-препаратов. Кроме того, разработанное техническое решение может являться частью программного комплекса, обеспечивающего автоматизированный выбор наиболее перспективных неоантигенов для последующего применения в персонифицированных мРНК-вакцинах.
|
| Количество опытных образцов |
0
|
| Количество просмотров |
3
|
| Наличие дополнительных файлов |
False
|
| Использование РИД правообладателем |
False
|
| Внешнее использование РИД |
False
|
| НИОКТР (JSON) |
{}
|
| ИКСИ (JSON) |
[]
|
| ИКСПО (JSON) |
[]
|
| ОЭСР (JSON) |
[]
|
| Дата первого статуса |
2025-12-18T10:40:46.561782+00:00
|
| Предполагаемый тип результата |
Изобретение
|
| Ожидаемая роль |
Исполнитель
|
| Заказчик |
МИНИСТЕРСТВО ЗДРАВООХРАНЕНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
|
| Руководитель работы |
Гущин Владимир Алексеевич
|
| Руководитель организации |
Гинцбург Александр Леонидович
|
| Регистрационный номер НИОКТР |
125021101877-7
|
| Последний статус |
Подтверждена, 626020400131-5, 2026-02-04 13:05:11 UTC
|
| ОКПД |
Услуги, связанные с научными исследованиями и экспериментальными разработками в области биотехнологии в области здоровья
|
| Ключевые слова |
высокопроизводительное секвенирование; неоантигены; меланома; опухолевые антигены
|
| Исполнители |
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ "НАЦИОНАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ЦЕНТР ЭПИДЕМИОЛОГИИ И МИКРОБИОЛОГИИ ИМЕНИ ПОЧЕТНОГО АКАДЕМИКА Н.Ф. ГАМАЛЕИ" МИНИСТЕРСТВА ЗДРАВООХРАНЕНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
|
| Авторы |
Васина Дарья Владимировна; Логунов Денис Юрьевич; Гинцбург Александр Леонидович; Гущин Владимир Алексеевич; Вердиев Бахтияр Исраил оглы; Почтовый Андрей Андреевич; Ремизов Тимофей Андреевич; Захарова Анастасия Андреевна; Клейменов Денис Александрович; Каприн Андрей Дмитриевич; Бетелин Владимир Борисович; Щербинин Дмитрий Николаевич; Тухватулина Наталья Михайловна; Джаруллаева Алина Шахмировна; Карп Ольга Эдвиновна; Карпулевич Евгений Андреевич; Шаталов Петр Алексеевич; Аветисян Арутюн Ишханович; Шегай Петр Викторович; Гугучкин Егор Павлович; Веселовский Егор Михайлович; Траспов Алексей Александрович; Галзитская Оксана Валериановна; Довидченко Никита Владимирович; Тухватулин Амир Ильдарович
|
| Коды тематических рубрик |
76.29.49 - Онкология; 62.37.35 - Вакцины, полученные методом генетической инженерии
|
| OESR |
Онкология; Биохимия и молекулярная биология
|
| Приоритеты научно-технического развития |
Отсутствует
|
