| Наименование РИД |
Программа для расчета порогового цикла ОТ-ПЦР в реальном времени методом регрессии случайного леса
|
| Реферат |
Программа для ЭВМ: Программа для расчета порогового цикла ОТ-ПЦР в реальном времени методом регрессии случайного леса.
Правообладатель: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт эволюционной физиологии и биохимии им. И.М. Сеченова Российской академии наук (ИЭФБ РАН)
194223, Российская Федерация, Санкт-Петербург, пр. Тореза, д. 44
ОГРН: 1027801535728 ИНН: 7802038273
Авторы: Пьянков Арсений Алексеевич (RU)
Программа выполняет следующие функции:
Программа предназначена для автоматизированного расчёта порогового цикла (Ct) в ОТ-ПЦР, при этом особенно эффективна при низкой начальной концентрации ДНК. Выполняется фильтрация шумовых участков флуоресцентных кривых, детекция момента выхода сигнала из уровня шума на основе анализа второй производной, а также извлечение информативных признаков (базовый уровень, наклон, площадь под кривой, максимум производных и др.). Для прогноза Ct используется заранее обученная модель RandomForest. Реакции без достоверного амплификационного роста помечаются NaN. Итоговые значения сохраняются в CSV.
Тип реализующей ЭВМ: IBM PC-совместимый ПК
Вид и версия операционной системы: Windows 7 и старше.
Язык программирования: Python
Объём программы для ЭВМ: 30,7 Мб
|
| Возможные направления использования |
Автоматизированный расчёт порогового цикла (Ct) в ОТ-ПЦР
|
| Количество опытных образцов |
1
|
| Количество просмотров |
1
|
| Наличие дополнительных файлов |
False
|
| Использование РИД правообладателем |
False
|
| Внешнее использование РИД |
False
|
| НИОКТР (JSON) |
{}
|
| ИКСИ (JSON) |
[]
|
| ИКСПО (JSON) |
[]
|
| ОЭСР (JSON) |
[]
|
| Дата первого статуса |
2026-01-19T09:47:00.305751+00:00
|
| Предполагаемый тип результата |
Программа для ЭВМ
|
| Ожидаемая роль |
Заказчик и Исполнитель совместно
|
| Заказчик |
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
|
| Руководитель работы |
Пьянков Арсений Алексеевич
|
| Руководитель организации |
Фирсов Михаил Леонидович
|
| Регистрационный номер НИОКТР |
125122615125-1
|
| Последний статус |
Подтверждена, 626020400172-8, 2026-02-04 14:35:50 UTC
|
| ОКПД |
Работы оригинальные научных исследований и экспериментальных разработок в области естественных и технических наук, кроме биотехнологии
|
| Ключевые слова |
детекция сигнала; пороговый цикл; ОТ ПЦР
|
| Исполнители |
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ НАУКИ ИНСТИТУТ ЭВОЛЮЦИОННОЙ ФИЗИОЛОГИИ И БИОХИМИИ ИМ. И.М. СЕЧЕНОВА РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК
|
| Авторы |
Пьянков Арсений Алексеевич
|
| Коды тематических рубрик |
34.05.17 - Методы биологических исследований
|
| OESR |
Биохимические методы исследования
|
| Приоритеты научно-технического развития |
в) переход к персонализированной, предиктивной и профилактической медицине, высокотехнологичному здравоохранению и технологиям здоровьесбережения, в том числе за счет рационального применения лекарственных препаратов (прежде всего антибактериальных) и использования генетических данных и технологий;
|
