| Наименование РИД |
Программа для автоматической валидации результатов ПЦР по кривой плавления продукта реакции
|
| Реферат |
Программа для ЭВМ: Программа для автоматической валидации результатов ПЦР по кривой плавления продукта реакции.
Правообладатель: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт эволюционной физиологии и биохимии им. И.М. Сеченова Российской академии наук (ИЭФБ РАН)
194223, Российская Федерация, Санкт-Петербург, пр. Тореза, д. 44
ОГРН: 1027801535728 ИНН: 7802038273
Авторы: Пьянков Арсений Алексеевич (RU)
Программа выполняет следующие функции:
Программа предназначена для автоматизированной оценки качества реакций по кривым плавления ПЦР. Входом служат табличные данные с рядами температур и соответствующей флуоресценцией. Программа имеет два режима работы: режим классической классификации, при которой извлекаются признаки, и каждая кривая относится к категории с помощью предварительно обученной модели машинного обучения, и режим адаптивной классификации, при котором исходные метки уточняются на основе соотношения высот основного и низкотемпературного пиков. В обоих режимах формируется визуализация пиков расплава в цветовой схеме, соответствующей категориям. В зависимости от режима используются следующие метки: good_product (нормальная амплификация), good_side_product (основной продукт с небольшим побочным), bad_side_product (значительный побочный продукт), no_amplification (отсутствие амплификации), primer_dimers (димеризация праймеров). Программа может быть полезна для стандартизации интерпретации кривых плавления, ускорения анализа больших партий данных и снижения субъективных ошибок при оценке качества ПЦР-реакций.
Тип реализующей ЭВМ: IBM PC-совместимый ПК
Вид и версия операционной системы: Windows 7 и старше.
Язык программирования: Python
Объём программы для ЭВМ: 13 КБ
|
| Возможные направления использования |
Автоматизированная оценка качества реакций по кривым плавления ПЦР при молекулярно-клеточных исследованиях
|
| Количество опытных образцов |
1
|
| Количество просмотров |
1
|
| Наличие дополнительных файлов |
False
|
| Использование РИД правообладателем |
False
|
| Внешнее использование РИД |
False
|
| НИОКТР (JSON) |
{}
|
| ИКСИ (JSON) |
[]
|
| ИКСПО (JSON) |
[]
|
| ОЭСР (JSON) |
[]
|
| Дата первого статуса |
2026-01-19T09:30:30.814575+00:00
|
| Предполагаемый тип результата |
Программа для ЭВМ
|
| Ожидаемая роль |
Заказчик и Исполнитель совместно
|
| Заказчик |
МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
|
| Руководитель работы |
Пьянков Арсений Алексеевич
|
| Руководитель организации |
Фирсов Михаил Леонидович
|
| Регистрационный номер НИОКТР |
125122615125-1
|
| Последний статус |
Подтверждена, 626020400174-2, 2026-02-04 14:36:41 UTC
|
| ОКПД |
Работы оригинальные научных исследований и экспериментальных разработок в области естественных и технических наук, кроме биотехнологии
|
| Ключевые слова |
режим адаптивной классификации; режим классической классификации
|
| Исполнители |
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ НАУКИ ИНСТИТУТ ЭВОЛЮЦИОННОЙ ФИЗИОЛОГИИ И БИОХИМИИ ИМ. И.М. СЕЧЕНОВА РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК
|
| Авторы |
Пьянков Арсений Алексеевич
|
| Коды тематических рубрик |
34.15.65 - Молекулярная патология. Молекулярная диагностика
|
| OESR |
Биохимические методы исследования
|
| Приоритеты научно-технического развития |
в) переход к персонализированной, предиктивной и профилактической медицине, высокотехнологичному здравоохранению и технологиям здоровьесбережения, в том числе за счет рационального применения лекарственных препаратов (прежде всего антибактериальных) и использования генетических данных и технологий;
|
