Новые подходы к идентификации белковых мишеней низкомолекулярных лекарственных препаратов в живых клетках с помощью технологии термопрофилирования протеома на примере ингибиторов сплайсинга
| Название НИОКТР | Новые подходы к идентификации белковых мишеней низкомолекулярных лекарственных препаратов в живых клетках с помощью технологии термопрофилирования протеома на примере ингибиторов сплайсинга |
|---|---|
| Аннотация | Данный проект посвящен разработке комплексного подхода к изучению механизмов действия лекарственных препаратов на примере ингибиторов сплайсинга с привлечением широкого спектра омиксных и клеточных технологий. Для исследования будут выбраны не менее пяти ингибиторов сплайсинга, среди которых будут как коммерчески доступные препараты (пладиенолид Б, E7107, H3B-8800, индисулам, ингибитор PRMT5), так и экспериментальный онкопрепарат FG1059, который ранее мы использовали как ингибитор фосфорилирования сплайсингового фактора SRSF4, угнетающего рост клеток глиобластомы как in vitro, так и in vivo [PMID: 36192632//Nature Cell Biol 2022]. Первый и наиболее важный этап проекта будет посвящен реализации термопротеомного профилирования по классическому и оптимизированному протоколам. Термопротеомное профилирование позволяет идентифицировать белки-мишени лекарственных препаратов в живых клетках, выявлять нецелевые и побочные взаимодействия, что важно для понимания молекулярных механизмов действия препарата. Оптимизация методики термопротеомного профилирования будет заключаться в отказе от дорогостоящих TMT-меток и в замене “data-dependent acquisition” (DDA) подхода в масс-спектрометрии на “data-independent acquisition” (DIA) подход, что позволит значительно удешевить методику и сделать ее доступной для широкого спектра задач, включая научные и фармакологические. По нашим предварительным данным ожидается, что оба подхода будут иметь схожую эффективность по количеству идентифицированных белков. Так как не существует точного протокола для валидации результатов термопротеомного профилирования, на следующих этапа проекта будет разработан порядок действий для проверки белковых мишеней на примере как минимум одного ингибитора сплайсинга, который будет обладать наибольшей цитотоксической селективностью в отношении опухолевых клеток по сравнению с нормальными клетками. Таким образом, на основании полученных экспериментальных данных мы сможем внести вклад в понимание цитотоксического механизма действия ингибиторов сплайсинга. Сформулированный и реализованный порядок валидации результатов термопротеомного профилирования в дальнейшем может быть использован для изучения механизма действия новых экспериментальных препаратов научными группами и фармацевтическими компаниями. |
| Доступ к ОКОГУ исполнителя | False |
| Количество связанных РИД | 0 |
| Количество завершенных ИКРБС | 0 |
| Сумма бюджета | 21000.0 |
| Дата начала | 2025-05-29 |
| Дата окончания | 2027-12-31 |
| Номер контракта | 25-15-00520 |
| Дата контракта | 2025-05-29 |
| Количество отчетов | 3 |
| УДК | 577.2:616-006 |
| Количество просмотров | 3 |
| Руководитель работы | Шендер Виктория Олеговна |
| Руководитель организации | Лагарькова Мария Андреевна |
| Исполнитель | ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ "ФЕДЕРАЛЬНЫЙ НАУЧНО-КЛИНИЧЕСКИЙ ЦЕНТР ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКОЙ МЕДИЦИНЫ ИМЕНИ АКАДЕМИКА Ю.М. ЛОПУХИНА ФЕДЕРАЛЬНОГО МЕДИКО-БИОЛОГИЧЕСКОГО АГЕНТСТВА" |
| Заказчик | Российский научный фонд |
| Федеральная программа | — |
| Госпрограмма | — |
| Основание НИОКТР | Грант |
| Последний статус | 2025-06-11 13:53:34 UTC, 2025-06-11 13:53:34 UTC |
| ОКПД | Услуги, связанные с научными исследованиями и экспериментальными разработками в области медицинских наук |
| Отраслевой сегмент | — |
| Минздрав | — |
| Межгосударственная целевая программа | — |
| Ключевые слова | ОМИКСНЫЕ ТЕХНОЛОГИИ; ИНГИБИТОРЫ СПЛАЙСИНГА; ХИМИОТЕРАПИЯ; ТЕРМОПРОТЕОМНОЕ ПРОФИЛИРОВАНИЕ; МАЛЫЕ МОЛЕКУЛЫ |
| Соисполнители | — |
| Типы НИОКТР | Фундаментальное исследование |
| Приоритетные направления | — |
| Критические технологии | — |
| Рубрикатор | 34.15.51 - Молекулярная онкология |
| OECD | — |
| OESR | Биохимия и молекулярная биология |
| Приоритеты научно-технического развития | в) переход к персонализированной, предиктивной и профилактической медицине, высокотехнологичному здравоохранению и технологиям здоровьесбережения, в том числе за счет рационального применения лекарственных препаратов (прежде всего антибактериальных) и использования генетических данных и технологий; |
| Регистрационные номера | — |