Соглашение с РНФ о выполнении проекта № 25-45-01051: "Нетипичные разновидности наследственного колоректального рака: изучение генетических причин и особенностей микробиома".

Название НИОКТР	Соглашение с РНФ о выполнении проекта № 25-45-01051: "Нетипичные разновидности наследственного колоректального рака: изучение генетических причин и особенностей микробиома".
Аннотация	Поиск новых генетических детерминант возникновения неоплазм - одна из наиболее значимых целей молекулярной онкологии. Рак толстой кишки (РТК) у молодых пациентов (до 40 лет) – это обогащенная наследственными случаями категория больных; она демонстрирует пятикратное увеличение доли моногенных опухолевых синдромов по сравнению с последовательными случаями РТК. Особенностью наследственных опухолей этой локализации является значительное количество синдромов, наследуемых по аутосомно-рецессивному типу (например, MUTYH-, NTHL1-, MSH3-, MBD4-ассоциированный полипоз). Генетические детерминанты большей части «молодых» случаев РТК до сих пор неизвестны. Основной целью данного проекта является выявление новых генов предрасположенности к РТК, в том числе прицельный поиск аутосомно-рецессивных локусов, связанных с возникновением заболевания в раннем возрасте. Мы ожидаем, что особенности российской и индийской популяций будут способствовать обнаружению именно таких разновидностей наследственного колоректального рака. Хотя славяне никогда не считались типичной founder-популяцией, в последние два десятилетия были обнаружены около пятидесяти связанных с различными заболеваниями «славянских» мутаций. Для многонационального населения Индии характерны локальные founder-аллели и относительно высокая доля близкородственных браков, что существенно увеличивает частоту патогенных гомозигот и облегчает выявление новых рецессивных локусов. В рамках данного Проекта обе стороны предполагают провести поиск новых РТК-ассоциированных локусов. Российские участники включат в исследование не менее 150 случаев РТК от пациентов младше 40 лет. Будет проведено ступенчатое NGS-тестирование: в первую очередь с помощью таргетного секвенирования будут исключены патогенные мутации в известных генах колоректального рака. Вторым шагом станет полноэкзомное секвенирование (WES) случаев, не содержащих мутаций в известных генах РТК («нетипичных» наследственных опухолей, ≈ 100). Помимо поиска моноаллельных каузативных вариантов, анализ будет сфокусирован на идентификации биаллельных кандидатных нарушений, потенциально связанных с аутосомно-рецессивным вариантом наследования риска опухолей. Индийские партнеры проведут аналогичный поиск новых наследственных детерминант в семейных РТК без выявленных генетических причин (n = 70), и для их валидации выполнят эксперименты на генетически модифицированных клеточных линиях. В задачи проекта также входит анализ молекулярных особенностей РТК, манифестировавших в раннем возрасте. В выборке «молодых» колоректальных раков российские участники проанализируют встречаемость клинически значимых молекулярных повреждений и интегральных биомаркеров - микросателлитной нестабильности, геномной нестабильности, высокой мутационной опухолевой нагрузки. Мы сравним полученные результаты с распределением аналогичных находок в образцах от более пожилых больных (>50 лет). Ещё одной задачей проекта станет изучение особенностей состава кишечной микробиоты у больных РТК молодого возраста. Предполагается, что некоторая доля случаев колоректальных раков у пациентов «высокого риска» может быть связана с микробным дисбиозом или присутствием в кишечнике специфических неблагоприятных микроорганизмов. В пользу этой гипотезы свидетельствуют данные о том, что неопластические ткани населяют особые микроорганизмы, многие из которых могут создавать провокационные условия для трансформации и прогрессирования опухолевых клонов: метаболизировать стероидные гормоны, синтезировать ДНК-повреждающие токсины и др. Таким образом, закономерным является предположение о том, что нарушения в кишечном микробиоме сами по себе являются важным фактором риска, в том числе, модифицирующим пенетрантность наследственных раковых мутаций. Данный фрагмент работы берет на себя индийский партнер, имеющий успешный опыт анализа микробных профилей с помощью метагеномного секвенирования нового поколения (Shotgun Metagenomic Sequencing, SMS).
Доступ к ОКОГУ исполнителя	False
Количество связанных РИД	0
Количество завершенных ИКРБС	0
Сумма бюджета	21000.0
Дата начала	2025-07-30
Дата окончания	2027-12-31
Номер контракта	25-45-01051
Дата контракта	2025-07-30
Количество отчетов	3
УДК	616-006
Количество просмотров	16
Руководитель работы	Иевлева Аглая Геннадиевна
Руководитель организации	Беляев Алексей Михайлович
Исполнитель	ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ "НАЦИОНАЛЬНЫЙ МЕДИЦИНСКИЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ЦЕНТР ОНКОЛОГИИ ИМЕНИ Н.Н. ПЕТРОВА" МИНИСТЕРСТВА ЗДРАВООХРАНЕНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
Заказчик	Российский научный фонд
Федеральная программа	Отсутствует
Госпрограмма	—
Основание НИОКТР	Грант
Последний статус	2025-09-24 13:41:43 UTC, 2025-09-24 13:41:43 UTC
ОКПД	Услуги, связанные с научными исследованиями и экспериментальными разработками в области медицинских наук
Отраслевой сегмент	—
Минздрав	—
Межгосударственная целевая программа	—
Ключевые слова	секвенирование нового поколения; молекулярно-генетические особенности; наследственная мутация; аутосомно-рецессивное наследование; наследственный рак толстой кишки
Соисполнители	—
Типы НИОКТР	Фундаментальное исследование
Приоритетные направления	—
Критические технологии	—
Рубрикатор	76.29.49 - Онкология; 76.03.39 - Медицинская генетика. Медико-генетическое консультирование; 34.15.51 - Молекулярная онкология; 31.27.31 - Биохимия опухолей; 34.15.23 - Молекулярная генетика
OECD	—
OESR	Онкология; Технологии, связанные с выявлением функционирования ДНК, белков и ферментов и как они влияют на начало заболевания и поддержание благополучия (генная диагностика и терапевтические вмешательства (фармакогеномика, генная терапия); Биохимия и молекулярная биология
Приоритеты научно-технического развития	в) переход к персонализированной, предиктивной и профилактической медицине, высокотехнологичному здравоохранению и технологиям здоровьесбережения, в том числе за счет рационального применения лекарственных препаратов (прежде всего антибактериальных) и использования генетических данных и технологий;
Регистрационные номера	—