| Название НИОКТР |
Научно-методологическое обеспечение молекулярно-генетического мониторинга в системе эпидемиологического надзора за возбудителями инфекционных заболеваний с использованием молекулярно-биологических и биоинформатических технологий
|
| Аннотация |
Бурное развитие технологий высокопроизводительного секвенирования (NGS) и биоинформатики за последние 15 лет привело к существенному снижению стоимости исследований и сделало геномный анализ доступным инструментом для биологии и медицины. В вирусологии и микробиологии NGS уже активно применяется для расшифровки геномов бактерий и вирусов (включая новые и редкие), изучения их эволюции и механизмов патогенности, а также для молекулярно-генетического мониторинга в рамках эпидемиологического надзора. Опыт пандемии COVID-19 показал, что оперативное выявление генетических изменений возбудителя, классификация геновариантов и их сопоставление с особенностями эпидемического процесса важны для разработки диагностических реагентов, оценки эффективности профилактических мер и принятия управленческих решений.
При этом, несмотря на развитие лабораторной инфраструктуры и вычислительных возможностей, в т. ч. в рамках особых национальных инициатив, для большинства клинически значимых патогенов отсутствуют стандартизированные и удобные готовые решения, позволяющие быстро запускать и масштабировать секвенирование в рутинной практике. Сложность дополнительно усиливается разнообразием современных платформ секвенирования и форматов данных: под разные приборы и наборы реагентов требуются специфические протоколы пробоподготовки, панели праймеров, параметры амплификации и библиотечной подготовки, а также адаптированные биоинформатические «пайплайны» (конвейеры), обеспечивающие сопоставимость результатов между лабораториями.
Цель проекта — создание набора готовых решений для секвенирования и анализа геномов патогенов человека, совместимых с современными NGS-платформами. Проект предусматривает разработку и оптимизацию лабораторных протоколов (включая пробоподготовку, библиотечную подготовку и этап секвенирования), дизайн и валидацию таргетных панелей/наборов праймеров, а также создание программного обеспечения/биоинформатических пайплайнов для контроля качества данных, сборки геномов, типирования и выявления мутаций, интерпретации результатов и формирования стандартизированных отчетов.
Результатом станет набор воспроизводимых и масштабируемых технологий и программных инструментов, обеспечивающих быстрый переход от образца к интерпретируемому геномному профилю возбудителя на разных платформах секвенирования, повышение сопоставимости данных между лабораториями, ускорение внедрения NGS в эпиднадзор и более оперативное реагирование на эпидемиологические риски.
|
| Доступ к ОКОГУ исполнителя |
True
|
| Количество связанных РИД |
0
|
| Количество завершенных ИКРБС |
0
|
| Сумма бюджета |
26467.321
|
| Дата начала |
2026-01-01
|
| Дата окончания |
2030-12-31
|
| Номер контракта |
141-03-2026-108
|
| Дата контракта |
2026-01-23
|
| Количество отчетов |
5
|
| УДК |
616-036.22
|
| Количество просмотров |
1
|
| Руководитель работы |
Хафизов Камиль Фаридович
|
| Руководитель организации |
Акимкин Василий Геннадьевич
|
| Исполнитель |
ФЕДЕРАЛЬНОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ НАУКИ "ЦЕНТРАЛЬНЫЙ НАУЧНО-ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ИНСТИТУТ ЭПИДЕМИОЛОГИИ" ФЕДЕРАЛЬНОЙ СЛУЖБЫ ПО НАДЗОРУ В СФЕРЕ ЗАЩИТЫ ПРАВ ПОТРЕБИТЕЛЕЙ И БЛАГОПОЛУЧИЯ ЧЕЛОВЕКА
|
| Заказчик |
ФЕДЕРАЛЬНАЯ СЛУЖБА ПО НАДЗОРУ В СФЕРЕ ЗАЩИТЫ ПРАВ ПОТРЕБИТЕЛЕЙ И БЛАГОПОЛУЧИЯ ЧЕЛОВЕКА
|
| Федеральная программа |
Отсутствует
|
| Госпрограмма |
Развитие науки и технологий
|
| Основание НИОКТР |
Государственное задание
|
| Последний статус |
2026-02-02 06:54:31 UTC, 2026-02-02 06:54:31 UTC
|
| ОКПД |
Услуги, связанные с научными исследованиями и экспериментальными разработками в области медицинских наук
|
| Отраслевой сегмент |
—
|
| Минздрав |
—
|
| Межгосударственная целевая программа |
—
|
| Ключевые слова |
болезни; мониторинг; секвенирование; вирусы; инфекции; патогены; надзор; биоинформатика; NGS; бактерии
|
| Соисполнители |
—
|
| Типы НИОКТР |
Разработка новых материалов, научно-методических материалов, продуктов, процессов, программ, устройств, типов, элементов, услуг, систем, методов, методик, рекомендаций, предложений, прогнозов
|
| Приоритетные направления |
—
|
| Критические технологии |
—
|
| Рубрикатор |
76.33.43 - Эпидемиология; 76.29.50 - Инфекционные болезни; 34.15.31 - Молекулярная биология вирусов
|
| OECD |
—
|
| OESR |
Эпидемиология; Инфекционные заболевания; Биохимия и молекулярная биология
|
| Приоритеты научно-технического развития |
в) переход к персонализированной, предиктивной и профилактической медицине, высокотехнологичному здравоохранению и технологиям здоровьесбережения, в том числе за счет рационального применения лекарственных препаратов (прежде всего антибактериальных) и использования генетических данных и технологий;
|
| Регистрационные номера |
—
|
