| Название НИОКТР |
Подготовка ddRAD-seq библиотек ДНК сосны обыкновенной и дуба черешчатого для секвенирования и первичная биоинформатическая обработка результатов (х/д 10722)
|
| Аннотация |
В результате исследования получены библиотеки ДНК на основании методики ddRAD-seq для природных и искусственных популяций сосны обыкновенной и дуба черешчатого из Воронежской области. Образцы были отсеквенированы на платформе Illumina NovaSeq X . Полученный массив данных был обработан с помощью разных биоинформатических подходов.
Анализ популяционной структуры 8 выборок Q.robur не выявил иерархической структуры или однозначного разделения на географические группы изученных популяций. Высокая генетическая неоднородность некоторых выборок может указывать на генетическую неоднородность популяций, и формирование мозаичных генотипов ввиду межвидовой гибридизации. По всем выборкам, средняя наблюдаемая гетерозиготность HO = 0,289, средняя ожидаемая гетерозиготность HE = 0,306, коэффициента инбридинга FIS = 0,076. Общая генетическая дифференциация FST = 0,014.
Для 10 выборок сосны обыкновенной на основании данных полногеномного генотипирования также не выявлено иерархической структуры, средняя наблюдаемая гетерозиготность HO =0,271, средняя ожидаемая гетерозиготность HE =0,279, коэффициента инбридинга FIS =0,050. Общая генетическая дифференциация FST =0,005.
|
| Доступ к ОКОГУ исполнителя |
False
|
| Количество связанных РИД |
0
|
| Количество завершенных ИКРБС |
0
|
| Сумма бюджета |
200.0
|
| Дата начала |
2025-07-17
|
| Дата окончания |
2025-11-19
|
| Номер контракта |
№ 25-1644
|
| Дата контракта |
2025-07-17
|
| Количество отчетов |
1
|
| УДК |
575.17
|
| Количество просмотров |
11
|
| Руководитель работы |
Орешкова Наталья Викторовна
|
| Руководитель организации |
Румянцев Максим Валерьевич
|
| Исполнитель |
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ АВТОНОМНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ "СИБИРСКИЙ ФЕДЕРАЛЬНЫЙ УНИВЕРСИТЕТ"
|
| Заказчик |
ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ "ВОРОНЕЖСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ ЛЕСОТЕХНИЧЕСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ Г.Ф. МОРОЗОВА"
|
| Федеральная программа |
Отсутствует
|
| Госпрограмма |
—
|
| Основание НИОКТР |
Договор со сторонней организацией
|
| Последний статус |
2025-11-10 09:15:58 UTC, 2025-11-18 13:20:10 UTC
|
| ОКПД |
Услуги, связанные с научными исследованиями и экспериментальными разработками в области биологических наук
|
| Отраслевой сегмент |
—
|
| Минздрав |
—
|
| Межгосударственная целевая программа |
—
|
| Ключевые слова |
SNP; Дуб черешчатый; Сосна обыкновенная; Структура популяций; Генетическое разнообразие; Полиморфизм; Дендрогеномика
|
| Соисполнители |
—
|
| Типы НИОКТР |
Разработка новых материалов, научно-методических материалов, продуктов, процессов, программ, устройств, типов, элементов, услуг, систем, методов, методик, рекомендаций, предложений, прогнозов
|
| Приоритетные направления |
—
|
| Критические технологии |
—
|
| Рубрикатор |
34.23.35 - Популяционная генетика; 34.23.41 - Экологическая генетика
|
| OECD |
—
|
| OESR |
Генетика и наследственность (медицинская генетика относится к разделу 3)
|
| Приоритеты научно-технического развития |
Отсутствует
|
| Регистрационные номера |
ikrbs: {'card_list': [{'id': '3LPQJBBI7FP92IW56SSPK0D9'}]}
|
