Использование полногеномного секвенирования в изучении полиморфизма новых генов- кандидатов мясной продуктивности для применения в маркерной селекции овец российских мериносовых пород

Название НИОКТР	Использование полногеномного секвенирования в изучении полиморфизма новых генов- кандидатов мясной продуктивности для применения в маркерной селекции овец российских мериносовых пород
Аннотация	Актуальность проекта связана с растущей потребностью в высококачественной баранине у переработчиков мясной продукции для российского рынка и экспорта за рубеж. На Северном Кавказе работают несколько перерабатывающих предприятий, но овцеводы не могут покрыть их потребности. Это связано с недостаточной мясной продуктивностью поголовья овец в Ставропольском крае. Экономическая ситуация диктует необходимость повышения мясной продуктивности российских пород овец мериносового направления с использованием современных генетических методов в селекционном процессе. В связи с отсутствием на сегодняшний день методик генотипирования овец по полиморфизмам генов, влияющих на мясную продуктивность, селекцию приходится вести традиционными методами. Проект направлен на поиск генов, влияющих на прижизненные и убойные показатели продуктивности у российских пород овец мериносового направления: Джалгинский меринос, Российский мясной меринос и Манычский меринос. Научной базой для исследования являются полученные нами ранее данные по генотипированию с использованием ДНК-биочипов Illumina и наша собственная база данных генотипов по результатам полногеномного секвенирования ДНК. Наличие такого научного задела и собственных данных о строении геномов овец существенно сократит стоимость проводимых исследований и сроки, необходимые для получения конечного результата. На основании ранее полученных данных будут выбраны не менее 5 новых генов-кандидатов, расположенных в наиболее достоверно связанных с продуктивными качествами локусах у трех пород мериносового направления. В список обязательно войдут гены THADA, ANKS1B, CASD1,CNTN3, MYO16. Также перечень генов будет расширен в процессе биоинформационного анализа получаемых результатов. По данным полногеномного секвенирования будет изучена структура выбранных генов, определены полиморфизмы, влияющие на функциональную активность генов и встречающиеся в достаточном количестве в исследуемых породах. Для выбранных полиморфизмов будут сконструированы тест-системы на основе ПЦР, позволяющие достаточно быстро и дешево проводить обследование большого количества животных. Будет выполнено расширенное обследование животных трех исследуемых пород с определением промеров статей, расчетом селекционных индексов и оценке убойных показателей выхода баранины. Также планируется углубленное исследование качества мяса с использованием гистологических и гистохимических методов. Таким образом, планируется расширить выборку до 300 голов в каждой из трех пород на втором году исследования и еще на 900 образцов – на третьем. Все обследованные животные будут генотипированы с использованием разработанных нами тест-систем и будет сделан окончательный вывод о возможности использования обнаруженных нами полиморфизмов в генах в качестве маркеров продуктивности при селекционной работе. Третий год исследований будет посвящен изучению ассоциаций предлагаемых полиморфизмов с микроструктурными параметрами мяса исследуемых животных. Также планируется сравнить частоты встречаемости аллельных вариантов полиморфизмов у двух поколений животных для оценки влияния проводимой селекционной работы и определения дальнейших направлений рационального скрещивания. Научная новизна проекта связана с планируемым исследованием впервые нами обнаруженных генов-кандидатов, влияющих на продуктивные качества у обособленной группы пород овец, адаптированной к условиям сухих степей Юга России. Нами впервые проведено полногеномное секвенирование изучаемых мериносовых пород, которое позволит обнаружить все имеющиеся полиморфизмы в генах продуктивности, в том числе – ранее не известные, отсутствующие в международных база данных. Некоторые из них могут оказаться уникальными и не встречаться больше ни у одной из пород овец в мире. Главным же итогом работы должна стать впервые предложенная методика генотипирования с использование разработанных нами тест-систем для повышения мясной продуктивности овец российских пород.
Доступ к ОКОГУ исполнителя	False
Количество связанных РИД	0
Количество завершенных ИКРБС	0
Сумма бюджета	15000.0
Дата начала	2025-09-10
Дата окончания	2028-06-30
Номер контракта	25-76-10086
Дата контракта	2025-09-10
Количество отчетов	3
УДК	636:59
Количество просмотров	3
Руководитель работы	Яцык Олеся Андреевна
Руководитель организации	Голосной Евгений Валерьевич
Исполнитель	ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ НАУЧНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ "СЕВЕРО-КАВКАЗСКИЙ ФЕДЕРАЛЬНЫЙ НАУЧНЫЙ АГРАРНЫЙ ЦЕНТР"
Заказчик	Российский научный фонд
Федеральная программа	Отсутствует
Госпрограмма	—
Основание НИОКТР	Грант
Последний статус	2025-11-10 17:43:38 UTC, 2025-11-10 17:43:38 UTC
ОКПД	Услуги, связанные с научными исследованиями и экспериментальными разработками в области сельскохозяйственных наук
Отраслевой сегмент	—
Минздрав	—
Межгосударственная целевая программа	—
Ключевые слова	ген; генетика; ДНК; полиморфизм; GWAS; геномная селекция; геном; полногеномный поиск ассоциаций; мышечная ткань; маркер-ассоциированная селекция
Соисполнители	—
Типы НИОКТР	Фундаментальное исследование; Поисковое (ориентированные фундаментальные) исследование
Приоритетные направления	—
Критические технологии	—
Рубрикатор	68.03.05 - Биология сельскохозяйственных животных
OECD	—
OESR	Селекция с помощью маркеров
Приоритеты научно-технического развития	г) переход к высокопродуктивному и экологически чистому агро- и аквахозяйству, разработку и внедрение систем рационального применения средств химической и биологической защиты сельскохозяйственных растений и животных, хранение и эффективную переработку сельскохозяйственной продукции, создание безопасных и качественных, в том числе функциональных, продуктов питания;
Регистрационные номера	—