| Аннотация |
Очевиден дефицит корректной и верифицированной информации, касающейся существующего в России биоразнообразия многих групп микроскопических грибов, включая фитопатогенные виды. Главнейшим шагом, составляющим основу всех дальнейших исследований, является корректная и надёжная идентификация вида гриба.
Анаморфные аскомицеты из рода Diaporthe это крупная и таксономически сложная группа микроскопических грибов. Большая часть видов Diaporthe ассоциированы с растениями. Скрытое разнообразие, фенотипическая пластичность, широкий круг растений-хозяев и парафилетичная природа рода Diaporthe долгое время затрудняли точную идентификацию видов и, как следствие, препятствовали достоверному анализу границ между видами.
В России виды Diaporthe широко распространены и могут занимать самые разные экологические ниши. Несмотря на успехи и богатые данные, полученные за последние десятилетия, таксономические исследования, посвящённые описанию биоразнообразия, классификации, филогении и таксономии рода Diaporthe в России до сих пор остаются вызовом. Несмотря на доступность актуальной литературы, и методов молекулярной филогении, до сих пор идентификацию видов Diaporthe часто осуществляют по связи с питающим растением и морфологическим признакам. Идентификацию по молекулярно-генетическим признакам проводят очень редко и в лучшем случае по нуклеотидным последствиям ITS-локуса. Известно, что такой подход не может быть использован для непротиворечивой, корректной и надёжной идентификации видов этого рода.
Установлено, что достоверную идентификацию видов Diaporthe следует осуществлять только с применением полифазного подхода в рамках консолидированной концепции видов (CSC), анализирующей совокупность морфологических и молекулярно-генетических признаков. В качестве основных используют молекулярные признаки, полученные в результате мультилокусного филогенетического анализа, а к филогенетическим исследованиям должен быть применён принцип генеалогической согласованности (GCPSR). Острой проблемой является определение границ видов в роде Diaporthe, поэтому для дефиниции границ видов Diaporthe в последние несколько лет используют методы коалесцентного анализа с реконструкцией деревьев Пуассона (PTP, mPTP) и оценки потенциальной рекомбинации между видами. Комбинация этих методов (CSC+GCPSR+PTP+mPTP) обладает высокой разрешающей способностью для надёжной и корректной идентификации видов Diaporthe.
Комплексного анализа биоразнообразия видов Diaporthe, ассоциированных не только с сельскохозяйственными растениями, но и с декоративными, ресурсно-значимыми и дикорастущими в России, согласно современным взглядам на систематику и таксономию рода, никогда не проводилось. Существующие надёжные и достоверные данные о видах Diaporthe в России охватывают лишь небольшую часть потенциального разнообразия.
Настоящий проект направлен на устранение пробелов в описании и изучении биоразнообразия видов Diaporthe на территории России. В рамках проекта планируется провести точную и надёжную идентификацию обширной коллекции штаммов, которая представляет широчайшее географическое распространение и охватывает разнообразные субстраты. Идентификация будет проведена согласно актуальным взглядам на концепцию рода Diaporthe и с использованием комплекса современных и актуальных методов (CSC+GCPSR+PTP+mPTP). Полученные результаты восполнят значительные пробелы и приблизят решение проблемы устранения дефицита корректной и верифицированной информации о биоразнообразии видов Diaporthe в России.
|
