| Название НИОКТР |
Использующая искусственный интеллект платформа функциональной аннотации омиксных данных в биологии и медицине
|
| Аннотация |
Будет создана платформа обработки Больших омиксных данных в контексте интерактомной модели человеческой клетки. Обученная модель сможет достраивать недостающие слои данных и создавать цифровой двойник объекта для моделирования изменения фенотипа в ответ на модификаторы (препараты, метаболиты и др.). Модель позволит определить круг оптимальных молекулярных маркеров различных патологических состояний и будет применима в диагностике, при генетическом скрининге популяции и для превентивной медицины.
Цель и задачи проекта
Проект нацелен на создание платформы обработки Больших омиксных данных, включая геномные, эпигеномные, транскриптомные, протеомные и метаболомные профили, в контексте интерактомной модели человеческой клетки. Такая модель основывается на интеграции данных о межмолекулярных взаимодействиях, в результате чего создается связанный граф, учитывающий взаимодействие максимального количества различных биологических молекул в клетке. К модели привязаны структуры молекул – модификаторов (ингибиторов, индукторов), которые способны влиять на функционирование молекулярных путей клетки, включая биохимические реакции, внутриклеточную и межклеточную сигнализацию. Создаваемая модель будет иметь ряд приложений для нужд практической медицины.
Приложения в онкологии:
геномный анализ для аннотации герминальных и соматических мутаций, вариабельности копийности генов, потери гетерозиготности хромосомных участков, предрасположенности к побочным эффектам терапии, микросателлитной нестабильности, дефицита гомологичной рекомбинации;
транскриптомный, протеомный и метаболомный анализ для установления молекулярного диагноза и поиска оптимальных активированных мишеней противоопухолевой терапии, в том числе комбинированной, в том числе на основе противоопухолевых вакцин и клеточных технологий;
single-cell (единичноклеточный);
транскриптомный анализ для определения клеточного состава опухоли и персонализации специфической терапии против опухолевых и неопухолевых стромальных клеток.
Генетический анализ неопухолевых патологий:
скрининг известных патогенных и потенциально патогенных мутаций/вариантов;
поиск нестабильных хромосомных участков и вариабельности копийности генов;
определение новых патогенных вариантов в исследуемых образцах;
аннотация предрасположенности к побочным эффектам лекарств;
персонализация подбора дозировки терапевтических препаратов.
Генетический скрининг условно здоровой части популяции:
скрининг известных патогенных и потенциально патогенных мутаций/вариантов;
поиск нестабильных хромосомных участков и вариабельности копийности генов;
аннотация предрасположенности к побочным эффектам лекарств;
персонализация подбора дозировки терапии препаратов;
реконструкция фенотипического портрета индивидуума.
Превентивная медицина условно здоровой части популяции:
определение эффективности репарации ДНК в функциональных тестах на живых мононуклеарных клетках крови испытуемых;
определение активности молекулярных путей репарации ДНК по данным транскриптомного профилирования мононуклеарных клеток крови испытуемых;
определение корреляции генетических вариантов генов системы репарации с наблюдаемой эффективностью репарации ДНК в живых мононуклеарных клетках крови испытуемых;
выработка практических рекомендаций для испытуемого на основании проведенного анализа.
|
| Доступ к ОКОГУ исполнителя |
False
|
| Количество связанных РИД |
0
|
| Количество завершенных ИКРБС |
0
|
| Сумма бюджета |
150000.0
|
| Дата начала |
2025-07-07
|
| Дата окончания |
2027-12-31
|
| Номер контракта |
25-03
|
| Дата контракта |
2025-07-07
|
| Количество отчетов |
3
|
| УДК |
57:51-76 57.02:001.57
|
| Количество просмотров |
18
|
| Руководитель работы |
Буздин Антон Александрович
|
| Руководитель организации |
Гусев Антон Сергеевич
|
| Исполнитель |
АВТОНОМНАЯ НЕКОММЕРЧЕСКАЯ ОБРАЗОВАТЕЛЬНАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ "НАУЧНО-ТЕХНОЛОГИЧЕСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ "СИРИУС"
|
| Заказчик |
АДМИНИСТРАЦИЯ ФЕДЕРАЛЬНОЙ ТЕРРИТОРИИ "СИРИУС"
|
| Федеральная программа |
Отсутствует
|
| Госпрограмма |
—
|
| Основание НИОКТР |
Грант
|
| Последний статус |
2025-11-18 06:53:27 UTC, 2025-11-18 06:53:27 UTC
|
| ОКПД |
Услуги, связанные с научными исследованиями и экспериментальными разработками в области медицинских наук
|
| Отраслевой сегмент |
—
|
| Минздрав |
—
|
| Межгосударственная целевая программа |
—
|
| Ключевые слова |
молекулярная диагностика; Искусственный интеллект; базы данных; комплексная аналитическая платформа; омиксные данные; персонализированная терапия; интерактомика; системная биоинформатика; создание новых терапевтических средств
|
| Соисполнители |
—
|
| Типы НИОКТР |
Поисковое (ориентированные фундаментальные) исследование
|
| Приоритетные направления |
—
|
| Критические технологии |
—
|
| Рубрикатор |
34.03.23 - Математическая биология и теоретическое моделирование биологических процессов. Биоинформатика
|
| OECD |
—
|
| OESR |
Биология (теоретическая, математическая, термическая, криобиология, биологический ритм)
|
| Приоритеты научно-технического развития |
в) переход к персонализированной, предиктивной и профилактической медицине, высокотехнологичному здравоохранению и технологиям здоровьесбережения, в том числе за счет рационального применения лекарственных препаратов (прежде всего антибактериальных) и использования генетических данных и технологий;
|
| Регистрационные номера |
—
|
