| Название НИОКТР |
Фенотипические и генотипические маркеры индикации, идентификации и антибиотикорезистентности бактерий рода Yersinia как основа совершенствования эпидемиологического надзора за псевдотуберкулезом и кишечным иерсиниозом
|
| Аннотация |
Псевдотуберкулез и кишечный иерсиниоз регистрируют на большей части территории РФ, во многих европейских странах, в США, Канаде, в ряде стран Азии, единичные случаи иерсиниозов отмечены в некоторых странах Южной Америки, Африки, в Австралии, Новой Зеландии. В соответствии с данными Европейского центра профилактики и контроля заболеваний (European Centre for Disease Prevention and Control, ECDC) возбудители иерсиниозов в Европе занимают четвертое место после представителей родов Campylobacter, Salmonella и энтерогеморрагических E. сoli среди патогенов, вызывающих диарейные заболевания пищевого происхождения. Заболеваемость иерсиниозами в Европе имеет тенденцию к росту. Оценивая рейтинг данных микроорганизмов по частоте возникновения вспышек, числу пострадавших и тяжести заболевания, Всемирная организация здравоохранения и Продовольственная и сельскохозяйственная организация ООН (Food and Agriculture Organization, FAO) относят их к числу наиболее важных эмерджентных патогенов.
По данным государственного доклада «О состоянии санитарно-эпидемиологического благополучия населения в Российской Федерации в 2023 году» экономический ущерб от заболеваний псевдотуберкулезом и кишечным иерсиниозом составил более 35 и 90 млн. руб. соответственно, существенно превысив расходы в 2022 г.
В РФ наблюдается тенденция к снижению интенсивности эпидемического процесса иерсиниозов со стабилизацией показателей на низком уровне. Однако заболеваемость неравномерно распределена по территории страны. Согласно данным федерального статистического наблюдения наиболее высокие показатели заболеваемости, в 2-5 раз и более превышающие федеральные значения, стабильно регистрируют в ряде субъектов Сибирского, Дальневосточного, Уральского, Северо-Западного федеральных округов.
В течение 2016-2020 гг. в РФ отмечалась спорадическая заболеваемость иерсиниозами. Вместе с тем, в 2021-2024 гг. в пяти субъектах СФО, ДФО, УФО зарегистрированы шесть групповых заболеваний с общим числом пострадавших более 300 человек. Эпидемические вспышки иерсиниозов обычно возникают внезапно вне зависимости от уровня заболеваемости в регионе и обусловлены появлением эпидемиологических рисков природного и социального характера, приводящих к активизации пищевого пути передачи возбудителя.
Проводимый геномный мониторинг показывает, что штаммы Y. pseudotuberculosis, доминирующие на эндемичных территориях РФ, характеризуются сочетанием основных хромосомных и плазмидных детерминант патогенности, обуславливающих риск развития генерализованных форм заболевания. При этом выявлены штаммы по генотипической характеристике идентичные возбудителям из других регионов мира, вызывающим, в основном, гастроинтестинальные проявления псевдотуберкулеза. Такие штаммы редко встречаются на территории РФ, однако их обнаружение обосновывает необходимость обследования, в том числе, на псевдотуберкулез, больных с проявлениями ОКИ неустановленной этиологии, с симптомами острого аппендицита и мезентериального лимфаденита. Методы молекулярного типирования в отношении российских штаммов возбудителя кишечного иерсиниоза используются ограниченно, данные о геновариантах Y. enterocolitica на отдельных территориях представлены единичными исследованиями.
Мониторинг распространения резистентности патогенов к антимикробным препаратам (АМП) – одна из приоритетных задач эпидемиологического надзора. Чувствительность российских штаммов Y. pseudotuberculosis и Y. enterocolitica к АМП в настоящее время охарактеризована фрагментарно. Информация о возбудителях иерсиниозов отсутствует в базах данных резистентности микроорганизмов к АМП и методических документах, действующих на территории России.
Отмеченные обстоятельства обосновывают необходимость разработки и внедрения методологических подходов к эпидемиологическому мониторингу иерсиниозов на основе новых данных о возбудителе и применения эффективных диагностических методов.
Цель работы: Совершенствование эпидемиологического мониторинга псевдотуберкулеза и кишечного иерсиниоза на основе использования комплекса эффективных методов внутривидовой дифференциации Y. pseudotuberculosis, Y. enterocolitica и этиологической диагностики заболеваний.
Задачи:
Изучить геномный полиморфизм штаммов Y. pseudotuberculosis (не менее 150 полногеномных последовательностей), выделенных в ряде регионов РФ, методами SNP-типирования, MLSТ, сgMLST и выполнить сравнительный анализ полученных результатов с имеющимися эпидемиологическими, фенотипическими и генотипическими характеристиками исследуемых штаммов.
Оценить эффективность использования различных молекулярных маркеров для мониторинга циркуляции возбудителя псевдотуберкулеза на территориях наблюдения.
Дополнить геоинформационную систему «Псевдотуберкулез. Геноварианты штаммов Yersinia pseudotuberculosis» (рег. № 2021622410) полученными результатами генотипирования для целей эпидемиологического анализа.
Получить генотипическую характеристику методами MLST, сgMLST, молекулярного серотипирования, выявить основные хромосомные и плазмидные детерминант вирулентности штаммов возбудителя кишечного иерсиниоза (не менее 50 полногеномных последовательностей), выделенных из различных источников на отдельных территориях РФ.
Выявить доминирующие и локальные геноварианты штаммов возбудителей иерсиниозов на отдельных территориях РФ.
Провести поиск генотипических маркеров антибиотикорезистентности у штаммов Y. pseudotuberculosis и Y. enterocolitica (не менее 100 штаммов)
Провести поиск Y. pseudotuberculosis, патогенных Y. enterocolitica и непатогенных иерсиний различных видов в пробах из объектов окружающей среды (ООС) в ряде областей СЗФО (не менее 300 проб).
Исследовать серопревалентность населения отдельных субъектов РФ к возбудителям иерсиниозов (не менее 500 образцов сыворотки крови (ОСК)).
Подтвердить иерсиниозную этиологию различных клинических вариантов хронических заболеваний желудочно-кишечного тракта (не менее 50 пациентов).
Провести ретроспективный анализ показателей заболеваемости иерсиниозами с момента официальной регистрации (1992-2027 гг.). Охарактеризовать проявления эпидемического процесса иерсиниозов на территории РФ в 2022-2027 гг.
|
| Доступ к ОКОГУ исполнителя |
True
|
| Количество связанных РИД |
0
|
| Количество завершенных ИКРБС |
0
|
| Сумма бюджета |
9363.195
|
| Дата начала |
2026-01-01
|
| Дата окончания |
2030-12-31
|
| Номер контракта |
141-03-2026-100
|
| Дата контракта |
2026-01-23
|
| Количество отчетов |
5
|
| УДК |
616.9
|
| Количество просмотров |
1
|
| Руководитель работы |
Воскресенская Екатерина Александровна
|
| Руководитель организации |
Тотолян Арег Артемович
|
| Исполнитель |
ФЕДЕРАЛЬНОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ НАУКИ "САНКТ-ПЕТЕРБУРГСКИЙ НАУЧНО-ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ИНСТИТУТ ЭПИДЕМИОЛОГИИ И МИКРОБИОЛОГИИ ИМ. ПАСТЕРА" ФЕДЕРАЛЬНОЙ СЛУЖБЫ ПО НАДЗОРУ В СФЕРЕ ЗАЩИТЫ ПРАВ ПОТРЕБИТЕЛЕЙ И БЛАГОПОЛУЧИЯ ЧЕЛОВЕКА
|
| Заказчик |
ФЕДЕРАЛЬНАЯ СЛУЖБА ПО НАДЗОРУ В СФЕРЕ ЗАЩИТЫ ПРАВ ПОТРЕБИТЕЛЕЙ И БЛАГОПОЛУЧИЯ ЧЕЛОВЕКА
|
| Федеральная программа |
Отсутствует
|
| Госпрограмма |
Развитие науки и технологий
|
| Основание НИОКТР |
Государственное задание
|
| Последний статус |
2026-02-05 14:10:14 UTC, 2026-02-05 14:10:14 UTC
|
| ОКПД |
Услуги, связанные с научными исследованиями и экспериментальными разработками в области медицинских наук
|
| Отраслевой сегмент |
—
|
| Минздрав |
—
|
| Межгосударственная целевая программа |
—
|
| Ключевые слова |
геновариант; чувствительность к антимикробным препаратам; детерминанты вирулентности; псевдотуберкулез; кишечный иерсиниоз; заболеваемость
|
| Соисполнители |
—
|
| Типы НИОКТР |
Разработка новых материалов, научно-методических материалов, продуктов, процессов, программ, устройств, типов, элементов, услуг, систем, методов, методик, рекомендаций, предложений, прогнозов
|
| Приоритетные направления |
—
|
| Критические технологии |
—
|
| Рубрикатор |
76.03.43 - Медицинская микробиология; 76.35.33 - Лабораторное дело; 76.29.50 - Инфекционные болезни
|
| OECD |
—
|
| OESR |
Эпидемиология; Инфекционные заболевания; Медицинские лабораторные технологии (включая анализ лабораторных образцов; диагностические технологии) (Биоматериалы относятся к разделу 2.9); Микробиология
|
| Приоритеты научно-технического развития |
в) переход к персонализированной, предиктивной и профилактической медицине, высокотехнологичному здравоохранению и технологиям здоровьесбережения, в том числе за счет рационального применения лекарственных препаратов (прежде всего антибактериальных) и использования генетических данных и технологий;
|
| Регистрационные номера |
—
|
